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Phenome-french plant phenotyping network

Montpellier Champ, Diaphen, nœud 5

Unités de recherche et/ou Unités expérimentales impliquées :

UE DiaScope et TGU AGAP, équipe DAVEM

 

Caractéristiques 

En bordure de la méditerranée, la plateforme DiaPHEN permet un travail spécifique sur le comportement des plantes en situation de stress hydrique estival sur des espèces annuelles (blés, maïs, …) et pérennes (pommier, …).

DiaPHEN dispose d’une caractérisation précise de l’environnement (pédologique et climatique) et propose un suivi en continu et en temps réel de l’évolution de la teneur en eau des sols. DiaPHEN met également à la disposition des équipes de recherche des outils permettant de caractériser l’évolution de la structure du couvert végétal et de faire de la prédiction du contenu biochimique de manière non destructive et dynamique, sur des échelles allant de l’organe à la parcelle.

Equipement

Station météo complète (réseau agroclim INRA) jouxtant les parcelles expérimentales, capteurs météo au sein des essais, réseau de sondes capacitives et réseau de tensiomètres, SPIR portable, greenseeker , LAI2200, caméra hyperspectrale NEO (en cours de développement), phénomobile (prise de spectres dans le visible, PIR, Lidar, éclairage actif -2016), chaine de phénotypage des grains en post –récolte (analyses morphométriques grain à grain, poids de récolte, SPIR en flux - 2016), matériel d’irrigation performant. Service SIG. Au niveau de l’unité : étuves de séchage, séchoirs ventilés, chambre froides, congélateurs, outils de battage et nettoyage des graines, broyeurs, laboratoire.

Services proposés

Prestation de base: façons culturales selon les objectifs du programme de recherche, mise à disposition des données et des outils de caractérisation environnementale.

Phénotypage au champ: plusieurs niveaux d’intervention possibles: mise à disposition d’outils et de compétence; réalisation des phénotypages en mode piéton; programmation des phénotypages haut débit par vecteur aérien ou roulant (phénomobile prévue en 2016).

La prise en charge est modulable depuis la prestation de base jusqu’au phénotypage instrumenté.

Phénotypage post récolte : Analyses morphométriques sur grains individuels et SPIR en flux sur la chaîne automatisée (prévu en 2016) pour les produits de récolte de la placette individuelle.

Publications (sélection)
  • Bonnal L, Julien L, Delalande M, Bastianelli D, 2013. How can dry forages databases be used to predict fresh grass composition by NIRS ? data transfer vs spectra transfer. 2-7 june 2013- 16th International Conference on Near Infrared Spectrometry, - La Grande Motte, France.
  • Vigneau, N., Ecarnot, M. Rabatel, G., and Roumet, P. (2011). Potential of field hyperspectral imaging as a non destructive method to assess leaf nitrogen content in Wheat. Field Crops Research 122: 25–31
  • Lacaze, X. and Roumet, P. (2011) Stage specific climatic characterization for studying QTL by Environment Interactions. Heredity (in revision).
  • Goretta, N., Roger, J., Aubert, M., Bellon Maurel, V., Compan, F. and Roumet, P. (2006) Determining vitreousness of durum wheat kernels using near infrared hyperspectral imaging. J. Near Infrared Spectrosc 14: 231-241.
  • Pilet-Nayel ML, Prospéri JM, Hamon C, Lesné A, Lecointre R, Le Goff I, Hervé M, Deniot G, Delalande M, Huguet T, Jacquet C and Baranger A. "AER1, a major gene conferring resistance to Aphanomyces euteiches in Medicago truncatula". Phytopathology, 2009, vol 99, n°2, 203:208

 

  •  Contacts:

Pilote de la plateforme : Romain Chapuis

Diascope

 

Montpellier Champ 1

Drône pour phénotypage

       

Montpellier Champ 2

Rampe d'irrigation